213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2827 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.49 
 
 
206 aa  161  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 
206 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
205 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
220 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
220 aa  143  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 
238 aa  141  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
230 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
233 aa  131  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  41.77 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
208 aa  125  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
218 aa  125  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
181 aa  124  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
236 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
186 aa  123  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
224 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  34.54 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
186 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
195 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
191 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
170 aa  87.8  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
170 aa  85.5  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
152 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
173 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
148 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
165 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  26.21 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  31.5 
 
 
146 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
172 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  26 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
165 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
147 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  26.47 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
147 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  30 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
167 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
167 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
174 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  25.43 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
167 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
165 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31494  predicted protein  30.71 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
169 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
163 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
172 aa  55.1  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
165 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
162 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
163 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
168 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  30.26 
 
 
161 aa  51.6  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1293  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>