160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2095 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  87.83 
 
 		 189 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  82.54 
 
 		 190 aa  331  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  87.08 
 
 		 190 aa  330  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  86.36 
 
 		 193 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  78.35 
 
 		 198 aa  318  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  79.37 
 
 		 202 aa  317  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  78.35 
 
 		 198 aa  317  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  78.35 
 
 		 198 aa  317  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  78.35 
 
 		 198 aa  317  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  82.22 
 
 		 198 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.84 
 
 		 197 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.84 
 
 		 197 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.84 
 
 		 197 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  77.84 
 
 		 198 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  77.84 
 
 		 198 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  78.84 
 
 		 196 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  77.13 
 
 		 196 aa  314  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.31 
 
 		 197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.31 
 
 		 199 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.31 
 
 		 197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  78.31 
 
 		 187 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  79.56 
 
 		 194 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  63.64 
 
 		 174 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  63.91 
 
 		 173 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  62.65 
 
 		 173 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  63.64 
 
 		 174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  62.42 
 
 		 174 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 		 174 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  58.68 
 
 		 174 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 		 174 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 		 174 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  58.18 
 
 		 174 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 		 172 aa  195  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  52.46 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 		 176 aa  187  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 		 173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 		 173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 		 169 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.94 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  27.54 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 164 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  28.28 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.46 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  22.79 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 168 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  27.57 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>