119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0960 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  91.44 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  93.05 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  87.7 
 
 		 188 aa  352  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.63 
 
 		 188 aa  350  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.77 
 
 		 186 aa  348  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.1 
 
 		 188 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.56 
 
 		 188 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  83.42 
 
 		 188 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  79.26 
 
 		 187 aa  313  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  75.27 
 
 		 185 aa  298  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.04 
 
 		 185 aa  294  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  67.88 
 
 		 166 aa  254  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 192 aa  214  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  48.63 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  49.2 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  30.9 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.95 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  24.86 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  24.74 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  26.14 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  24.39 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  26.35 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  22.46 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  21.74 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  28.21 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  27.33 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.67 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  25.95 
 
 		 146 aa  45.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  25 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 166 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2918  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  26.44 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.49 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  23.27 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  24.53 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>