144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1738 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  98.99 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  98.99 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  98.99 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  97.98 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  95.96 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.88 
 
 		 197 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.88 
 
 		 197 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.88 
 
 		 197 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.37 
 
 		 202 aa  362  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  88.44 
 
 		 196 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.37 
 
 		 199 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.37 
 
 		 197 aa  360  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.37 
 
 		 197 aa  360  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  89.06 
 
 		 196 aa  357  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  90.32 
 
 		 187 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  85.26 
 
 		 194 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  78.69 
 
 		 189 aa  317  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  77.84 
 
 		 202 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  80 
 
 		 190 aa  313  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  80 
 
 		 190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  80.11 
 
 		 193 aa  300  9e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  63.91 
 
 		 174 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  64.24 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  62.42 
 
 		 173 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 		 174 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 		 174 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 		 174 aa  217  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  62.13 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 		 174 aa  211  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  59.52 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 		 172 aa  191  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 176 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  52.33 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 		 173 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 		 173 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 169 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  48.37 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.36 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.36 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  26.28 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.39 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  26.43 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  22.63 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>