198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3178 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
220 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
207 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.49 
 
 
206 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
256 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  42 
 
 
220 aa  155  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
205 aa  151  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
207 aa  150  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  39 
 
 
220 aa  149  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
206 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  40.5 
 
 
238 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 
220 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  42.96 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
238 aa  138  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 
231 aa  138  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.76 
 
 
224 aa  131  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
180 aa  128  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 
208 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
186 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
170 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 
169 aa  85.5  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  32.14 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  32 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
169 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
171 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
174 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
172 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
148 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
149 aa  58.2  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
174 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  31.75 
 
 
146 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  29.17 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  29.24 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  30.77 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.45 
 
 
202 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
146 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 
147 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
147 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
166 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3617  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.04 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  28.89 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>