164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0977 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  75.9 
 
 
169 aa  271  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
168 aa  178  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
171 aa  97.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
170 aa  94.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
169 aa  89  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
179 aa  84  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  28 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
256 aa  63.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
162 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
238 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
220 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
220 aa  60.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
165 aa  60.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
192 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  26 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
220 aa  58.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  28.47 
 
 
146 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
147 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.07 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  26.39 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
191 aa  54.7  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
172 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
224 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
163 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 
236 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>