158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3319 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.41 
 
 
162 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
163 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
163 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  54.25 
 
 
163 aa  177  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.01 
 
 
161 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
165 aa  168  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
160 aa  167  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
173 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
168 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
159 aa  164  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
168 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
162 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
165 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
165 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
165 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
164 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
165 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
172 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
186 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.37 
 
 
172 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
188 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
167 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
172 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
167 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
167 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
188 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
167 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
174 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
192 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
154 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
152 aa  131  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 
152 aa  131  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
152 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
152 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
152 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.52 
 
 
152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
154 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.04 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42 
 
 
151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.4 
 
 
152 aa  123  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
154 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
170 aa  61.6  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
152 aa  56.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
256 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31494  predicted protein  29.28 
 
 
221 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
206 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
238 aa  47.8  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
175 aa  47.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
181 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
183 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
183 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>