152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3291 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
152 aa  313  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
152 aa  313  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
152 aa  313  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  91.45 
 
 
152 aa  290  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.47 
 
 
152 aa  289  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.47 
 
 
152 aa  289  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.47 
 
 
152 aa  289  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.47 
 
 
152 aa  289  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.47 
 
 
152 aa  289  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  287  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  87.5 
 
 
152 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.82 
 
 
152 aa  284  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.16 
 
 
152 aa  284  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  87.5 
 
 
152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.84 
 
 
152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.38 
 
 
154 aa  242  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 
154 aa  239  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 
152 aa  237  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72 
 
 
151 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.82 
 
 
154 aa  225  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
154 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
165 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.11 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
162 aa  180  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.85 
 
 
163 aa  176  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.03 
 
 
162 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.85 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  52.7 
 
 
163 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
165 aa  164  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
165 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
173 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
160 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
159 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
165 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
165 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
168 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
168 aa  157  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
174 aa  156  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
172 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
168 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
188 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
186 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
188 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
192 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.97 
 
 
162 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
167 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
167 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
167 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
173 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
172 aa  146  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
168 aa  146  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
167 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
172 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
176 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
175 aa  131  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
205 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 
238 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0988  phosphoribosyltransferase-like protein  29.58 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.458931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  27.48 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
169 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  25.4 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
176 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>