79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0988 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0988  phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.458931 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  25.53 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0991  putative purine phosphoribosyltransferase related protein  36.13 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14851  putative purine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.630625  normal  0.0718279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
179 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 
165 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
164 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
207 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10661  putative purine phosphoribosyl transferase-related protein  31.93 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.323489  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
218 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10661  putative purine phosphoribosyltransferase-related protein  31.93 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.189399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.53 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0655  phosphoribosyltransferase family protein  25.38 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09061  putative purine phosphoribosyltransferase-related protein  26.83 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  23.74 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.43 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0239  putative purine phosphoribosyltransferase related protein  26.02 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.910675  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 
186 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  23.08 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  23.23 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  27.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.07 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.82 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  21.19 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.65 
 
 
168 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1704  phosphoribosyltransferase family protein  21.77 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.107822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.57 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.6 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  21.66 
 
 
169 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10641  putative purine phosphoribosyltransferase-related protein  26.89 
 
 
131 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  19.87 
 
 
220 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.29 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.34 
 
 
192 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>