162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0003 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 154 aa  321  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  246  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  244  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.68 
 
 		 152 aa  244  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  74.34 
 
 		 152 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.38 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.38 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.38 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.43 
 
 		 152 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.68 
 
 		 152 aa  242  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.37 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.08 
 
 		 152 aa  240  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.52 
 
 		 152 aa  239  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.99 
 
 		 154 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.69 
 
 		 152 aa  218  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 		 151 aa  216  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.74 
 
 		 154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.34 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.68 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.36 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 163 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 168 aa  153  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.33 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 173 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 		 188 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 192 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 172 aa  126  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 208 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 220 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 202 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  28.66 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  23.6 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  26.09 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 238 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 		 220 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  23.13 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.17 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>