180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1680 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 
220 aa  248  5e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  55.91 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
220 aa  241  5e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 
220 aa  240  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
256 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  46.59 
 
 
207 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
205 aa  162  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
218 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
206 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
206 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  39.76 
 
 
233 aa  138  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
232 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
230 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
231 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.77 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  37.42 
 
 
181 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
186 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
195 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  28.35 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
147 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
171 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  28 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  28.67 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
165 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  28.17 
 
 
146 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
170 aa  62.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
146 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
165 aa  62  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 
148 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  26 
 
 
170 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
165 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  27.15 
 
 
173 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
165 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
167 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
159 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
174 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
152 aa  55.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
151 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
172 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
176 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  23.38 
 
 
168 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0329  phosphoribosyltransferase-like protein  27.74 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  31.13 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  26.28 
 
 
189 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
174 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
174 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
174 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  26.35 
 
 
202 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
152 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>