174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0429 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  64.38 
 
 
147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  64.38 
 
 
146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  63.7 
 
 
147 aa  208  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  63.7 
 
 
146 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  63.01 
 
 
146 aa  203  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  61.64 
 
 
147 aa  202  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  65.07 
 
 
149 aa  201  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 
148 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
207 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
220 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
165 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  26.21 
 
 
206 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  28 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  26.12 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  33.83 
 
 
230 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
189 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
233 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  24.63 
 
 
208 aa  54.3  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
202 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
236 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  30.17 
 
 
161 aa  53.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
179 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 
173 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
159 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
231 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
165 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
174 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  26.28 
 
 
196 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  30.36 
 
 
193 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.28 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.24 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
232 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
167 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.16 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  22.92 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.01 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  26.12 
 
 
198 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.01 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.01 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.67 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.01 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.67 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24 
 
 
162 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.13 
 
 
154 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
220 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>