222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1686 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 
206 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
206 aa  164  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  42.42 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
220 aa  158  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
220 aa  149  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 
220 aa  143  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
220 aa  141  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 
236 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
232 aa  134  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
224 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 
233 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
218 aa  124  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
208 aa  122  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
207 aa  122  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  33 
 
 
205 aa  121  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
180 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
195 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
186 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 
171 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
165 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  32 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  28 
 
 
146 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2486  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
167 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.98 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
147 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  30.38 
 
 
161 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 
253 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
174 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
154 aa  53.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
174 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
146 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  28.47 
 
 
173 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 
165 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
176 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1260  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  24.41 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  25.2 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
147 aa  49.7  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
167 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0777  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.761508  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 
188 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
164 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
196 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
165 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 
172 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
188 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
160 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>