57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1751 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1955  phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 184 aa  90.9  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.100641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 181 aa  51.2  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  34 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 		 232 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 236 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 256 aa  44.7  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0655  phosphoribosyltransferase family protein  30.46 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  23.84 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09061  putative purine phosphoribosyltransferase-related protein  26.72 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228955 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  27.05 
 
 		 798 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0239  putative purine phosphoribosyltransferase related protein  26.72 
 
 		 127 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.910675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 147 aa  42  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  25 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 		 233 aa  40.8  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>