50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1159 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.42 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  49.2 
 
 		 188 aa  187  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 		 191 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 		 188 aa  184  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.11 
 
 		 186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 		 166 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.99 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.26 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 188 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 		 192 aa  178  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  24.24 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  23.67 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  22.53 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.03 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  24.05 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  23.84 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  25.97 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  21.86 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  24.72 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 		 181 aa  42  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 206 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  24.42 
 
 		 186 aa  42  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>