102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2008 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  66.28 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.02 
 
 
187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
186 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
186 aa  208  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
185 aa  206  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
188 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
188 aa  204  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.24 
 
 
188 aa  203  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.24 
 
 
188 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 
188 aa  201  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  197  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 
166 aa  195  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  45.74 
 
 
207 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  24.58 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  22.5 
 
 
238 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
179 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  26.92 
 
 
146 aa  51.6  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  22.7 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  30.6 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  27.57 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0421  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
146 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.56 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.59 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  28.71 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
170 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  21.86 
 
 
180 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  27.68 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  23.95 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.27 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 
171 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
206 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  28.88 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  25.28 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  25.28 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2918  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  23.44 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
256 aa  45.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  22.58 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.49 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
149 aa  45.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
163 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  24.69 
 
 
218 aa  45.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.41 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.96 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.41 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.41 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.41 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  25.55 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  25.3 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  27.17 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  24.32 
 
 
161 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5350  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  24.03 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1304  Uracil phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>