180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2343 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 163 aa  324  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  66.04 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 170 aa  167  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  56.13 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  57.79 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  54.61 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 195 aa  94  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  35.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  30.07 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  27.78 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 231 aa  72  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  30.61 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  33.55 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  32.87 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>