161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1684 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  65.07 
 
 
146 aa  201  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  63.01 
 
 
146 aa  197  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  60.54 
 
 
147 aa  196  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  60.54 
 
 
147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  60.96 
 
 
146 aa  193  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  60.54 
 
 
146 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
147 aa  183  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
148 aa  168  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
152 aa  121  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
170 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
184 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  32.77 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
206 aa  60.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
179 aa  60.1  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
202 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
195 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
190 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  32.79 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
220 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
206 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
206 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
205 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
181 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.68 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
174 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
174 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
189 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 
208 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
202 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
187 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
233 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
197 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
197 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 
180 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.56 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
173 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
230 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
192 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
167 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  26.12 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.16 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.33 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
236 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.45 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>