145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1071 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  96.79 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  96.02 
 
 		 193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  81.82 
 
 		 189 aa  331  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  87.08 
 
 		 202 aa  330  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  85 
 
 		 197 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  85 
 
 		 197 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  85 
 
 		 197 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  84.44 
 
 		 202 aa  321  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  84.44 
 
 		 199 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  84.44 
 
 		 197 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  84.44 
 
 		 197 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  84.44 
 
 		 187 aa  317  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  81.18 
 
 		 196 aa  317  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  83.33 
 
 		 196 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  80.54 
 
 		 198 aa  314  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  80.54 
 
 		 198 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  80.54 
 
 		 198 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  80.54 
 
 		 198 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  80 
 
 		 198 aa  313  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  80 
 
 		 198 aa  313  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  80.54 
 
 		 198 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  82.22 
 
 		 194 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  66.67 
 
 		 174 aa  234  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  66.87 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 		 174 aa  226  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 		 174 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  64.24 
 
 		 174 aa  225  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  64.24 
 
 		 174 aa  224  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  61.68 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  64.46 
 
 		 173 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  61.82 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 		 174 aa  217  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  60.98 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 172 aa  194  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  53.99 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  54.88 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 173 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  49.02 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  26.28 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  27.14 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.11 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  22.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.48 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  27.74 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  28.71 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1031  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.596524  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 154 aa  48.5  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.09 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  23.31 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>