136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1884 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 174 aa  362  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  90.23 
 
 		 174 aa  333  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  86.78 
 
 		 174 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  84.97 
 
 		 174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  85.63 
 
 		 174 aa  317  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  84.39 
 
 		 174 aa  315  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  85.63 
 
 		 174 aa  315  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  85.06 
 
 		 174 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  82.76 
 
 		 174 aa  311  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  71.84 
 
 		 173 aa  264  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  70.69 
 
 		 173 aa  261  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 		 190 aa  217  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  60 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  59.04 
 
 		 189 aa  213  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 		 196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60.61 
 
 		 202 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60.61 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60.61 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60.61 
 
 		 197 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 198 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 198 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  58.18 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 198 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 198 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 198 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 198 aa  207  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  59.15 
 
 		 198 aa  207  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 		 194 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60 
 
 		 199 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60 
 
 		 197 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  49.4 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  46.41 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.46 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  28.99 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  31.21 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1476  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1507  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 		 220 aa  52  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.77 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 256 aa  51.2  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  27.59 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  27.34 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>