149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1102 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
174 aa  361  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  99.43 
 
 
174 aa  358  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  92.44 
 
 
174 aa  336  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  89.6 
 
 
174 aa  330  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  89.02 
 
 
174 aa  328  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  88.37 
 
 
174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  86.13 
 
 
174 aa  322  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  86.05 
 
 
174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  84.97 
 
 
174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  72.51 
 
 
173 aa  263  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  72.51 
 
 
173 aa  260  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  64.24 
 
 
190 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  63.03 
 
 
193 aa  223  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  62.42 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
198 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
198 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
198 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
198 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  62.42 
 
 
197 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  62.42 
 
 
202 aa  217  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 
202 aa  217  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  62.42 
 
 
197 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  62.42 
 
 
197 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.82 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.82 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.82 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.82 
 
 
187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 
194 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  50 
 
 
198 aa  177  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
172 aa  174  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
169 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
176 aa  172  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
173 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
173 aa  170  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  45.75 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.85 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
236 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 
220 aa  54.7  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  28.99 
 
 
146 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
220 aa  54.3  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 
224 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
238 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
207 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  27.74 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
238 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
256 aa  51.6  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
164 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1507  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
189 aa  51.2  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1476  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.36 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  31.01 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
231 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
168 aa  48.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
233 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>