165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1408 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  90.21 
 
 
196 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  89.69 
 
 
196 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  88.24 
 
 
197 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  88.24 
 
 
197 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  88.24 
 
 
197 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.17 
 
 
202 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.7 
 
 
199 aa  350  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.7 
 
 
197 aa  350  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  87.7 
 
 
197 aa  350  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  88.11 
 
 
187 aa  347  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  85.26 
 
 
198 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  85.26 
 
 
198 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  83.85 
 
 
198 aa  339  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  83.85 
 
 
198 aa  339  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  83.85 
 
 
198 aa  339  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
198 aa  338  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  82.81 
 
 
198 aa  337  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  82.97 
 
 
190 aa  317  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  79.78 
 
 
189 aa  313  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  82.22 
 
 
190 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  79.56 
 
 
202 aa  308  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  81.82 
 
 
193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  64.63 
 
 
174 aa  220  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  64.02 
 
 
174 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  62.65 
 
 
173 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
174 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 
174 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  60.84 
 
 
173 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  61.59 
 
 
174 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  60.37 
 
 
174 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  60.37 
 
 
174 aa  208  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  59.76 
 
 
174 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
172 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
172 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
176 aa  181  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
173 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
173 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  50.28 
 
 
198 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
169 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  47.06 
 
 
161 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
165 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
165 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
224 aa  58.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 
147 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.36 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
165 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 
146 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  26.28 
 
 
146 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
206 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
168 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
168 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 
164 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
178 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
232 aa  51.6  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
208 aa  51.6  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  28.18 
 
 
146 aa  51.6  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
233 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  32 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
676 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  25.55 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  21.9 
 
 
147 aa  48.5  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 
231 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
195 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
682 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
152 aa  48.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>