146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2596 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
174 aa  361  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  90.23 
 
 
174 aa  333  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  87.93 
 
 
174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  86.71 
 
 
174 aa  324  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  86.13 
 
 
174 aa  322  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  85.63 
 
 
174 aa  318  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  86.21 
 
 
174 aa  318  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  84.48 
 
 
174 aa  313  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  83.33 
 
 
174 aa  312  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  71.84 
 
 
173 aa  265  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  71.84 
 
 
173 aa  266  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  61.08 
 
 
193 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  61.68 
 
 
190 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  61.31 
 
 
189 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  62.65 
 
 
196 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  60.48 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  62.65 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.68 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.68 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.68 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.68 
 
 
202 aa  217  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
198 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
198 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  58.68 
 
 
202 aa  214  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  60.24 
 
 
198 aa  214  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  60.48 
 
 
198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.08 
 
 
199 aa  213  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
194 aa  213  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.08 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.08 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  61.08 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  51.55 
 
 
176 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
172 aa  174  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  49.4 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
173 aa  170  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
173 aa  170  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  47.06 
 
 
161 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
208 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  30.43 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
224 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  29.59 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.75 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
236 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  24.22 
 
 
205 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
232 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
238 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
206 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
220 aa  54.7  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  28.97 
 
 
146 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  31.85 
 
 
197 aa  54.3  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
256 aa  52.4  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 
231 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  26.21 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 
233 aa  51.2  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1476  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
189 aa  51.2  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
167 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1507  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  26.39 
 
 
218 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
207 aa  48.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
230 aa  47.4  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.38 
 
 
168 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>