195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1412 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 
207 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  42.46 
 
 
206 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
206 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
220 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
238 aa  137  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
256 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
224 aa  118  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 
233 aa  118  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
230 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
205 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
218 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 
181 aa  112  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
232 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 
231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
169 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  32 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  33.07 
 
 
161 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
171 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
147 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
172 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
147 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
169 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
149 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
172 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
146 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  28.36 
 
 
146 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
173 aa  55.1  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
174 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  28.83 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
132 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3996  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
178 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.5 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
188 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
188 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
188 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2486  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
170 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
186 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
178 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1955  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.100641  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  34.68 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>