57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1955 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1955  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 184 aa  354  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.100641  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  26.45 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  26.04 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.95 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  24.1 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  22.37 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  26.43 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.52 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  24.67 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3516  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3441  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00042277  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2515  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3267  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3518  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3480  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1296  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2812  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500056  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0437  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1148  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918152  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0515  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 220 aa  42  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  23.68 
 
 		 208 aa  42  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  25.81 
 
 		 161 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0559  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253345  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0589  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0107  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2794  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 253 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  20.55 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.03 
 
 		 147 aa  41.2  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.14 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>