135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0982 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  81.36 
 
 
238 aa  387  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  81.82 
 
 
220 aa  389  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  77.73 
 
 
220 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 
238 aa  240  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  52.04 
 
 
256 aa  224  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
205 aa  188  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  46.5 
 
 
206 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 
207 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
218 aa  138  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 
224 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
232 aa  124  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
180 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
208 aa  123  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  40 
 
 
181 aa  122  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
186 aa  122  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
186 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  34 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  32.61 
 
 
146 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 
170 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0329  phosphoribosyltransferase-like protein  32.12 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
171 aa  62  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
147 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
147 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
146 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  27.33 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
170 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  29.79 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
171 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
170 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  27.66 
 
 
146 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
165 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 
174 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  27.13 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
167 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
174 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
167 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
174 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
165 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
165 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
165 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  28.31 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 
160 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
174 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
167 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 
174 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
172 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  24.18 
 
 
174 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 
185 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 
154 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
174 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
173 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
186 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 
164 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  26.03 
 
 
132 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 
165 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
181 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
181 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
154 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
184 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>