More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0744 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  37.42 
 
 
195 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
179 aa  119  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.14 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
218 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
186 aa  111  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
220 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
232 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 
206 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
238 aa  98.2  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
220 aa  94  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  34 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  31.01 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2885  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.771483  normal  0.0159432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  23.95 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.28 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  23.7 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  26.51 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  26.9 
 
 
146 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1928  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.1 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
190 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 
185 aa  57.8  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  29.11 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  26.45 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  21.64 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_698  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.2 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  26.42 
 
 
173 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  21.64 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.7 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  26.87 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1332  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00674757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>