81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02434 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  79.75 
 
 		 185 aa  277  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  72.39 
 
 		 186 aa  267  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  71.78 
 
 		 185 aa  264  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.78 
 
 		 186 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.7 
 
 		 188 aa  255  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  67.88 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.09 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.88 
 
 		 188 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.48 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  66.06 
 
 		 188 aa  247  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.46 
 
 		 188 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 		 188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 192 aa  191  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  34.09 
 
 		 197 aa  80.5  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  31.74 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  24.24 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  25 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  26.28 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.78 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.74 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  28.79 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  26.67 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  23.19 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 		 256 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  24.79 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.5 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.74 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  24.82 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0731  purine phosphoribosyltransferase, putative  23.08 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal  0.290491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 170 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  23.08 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf377  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 183 aa  42  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103753  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  24.65 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>