116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3539 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  80.65 
 
 
186 aa  323  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  82.89 
 
 
188 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  80.11 
 
 
186 aa  316  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  81.28 
 
 
188 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  81.28 
 
 
188 aa  314  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  80.21 
 
 
188 aa  313  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  79.26 
 
 
188 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.54 
 
 
188 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.54 
 
 
188 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.54 
 
 
188 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.54 
 
 
188 aa  307  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.01 
 
 
188 aa  306  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.01 
 
 
188 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.01 
 
 
188 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  77.01 
 
 
188 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  76.47 
 
 
188 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.53 
 
 
185 aa  292  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.13 
 
 
185 aa  289  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  67.48 
 
 
166 aa  248  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  56.73 
 
 
192 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  54.02 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
207 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  31.43 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  29.11 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.62 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.56 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 
179 aa  52  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
168 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  25.52 
 
 
146 aa  51.6  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
218 aa  51.2  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  24.24 
 
 
146 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 
147 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  25.13 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
148 aa  49.3  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.69 
 
 
146 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
220 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
205 aa  47.8  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
230 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf377  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
183 aa  47  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  24.73 
 
 
220 aa  45.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
206 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
173 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  28 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.5 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.5 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.5 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.5 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.5 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>