117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0833 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.89 
 
 		 188 aa  364  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  91.44 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.3 
 
 		 188 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.3 
 
 		 188 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.3 
 
 		 188 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  89.3 
 
 		 188 aa  357  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.77 
 
 		 188 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.77 
 
 		 188 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.77 
 
 		 188 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.77 
 
 		 188 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.24 
 
 		 188 aa  353  7.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  90.43 
 
 		 186 aa  352  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  89.89 
 
 		 186 aa  348  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  86.17 
 
 		 188 aa  345  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  85.64 
 
 		 188 aa  344  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  82.89 
 
 		 187 aa  322  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  76.34 
 
 		 185 aa  303  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  73.66 
 
 		 185 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  67.88 
 
 		 166 aa  252  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  50.82 
 
 		 188 aa  211  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 		 191 aa  204  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  31.32 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.22 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  28.14 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  24.69 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  29.49 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  24.59 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  25.9 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  27.22 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1163  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.433004  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1071  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1227  putative nucleotide phosphoribosyltransferase protein  27.95 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000789245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.93 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.56 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  25.15 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  22.36 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.31 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  23.42 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2343  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2177  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2215  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100967  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2918  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  27.11 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0074  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.95 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>