223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1738 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  72.89 
 
 		 170 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  68.1 
 
 		 171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  68.87 
 
 		 170 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 		 170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  54.25 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 208 aa  87.8  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 		 206 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 220 aa  85.5  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 206 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  34.23 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  30.28 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  32.17 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  34.73 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  33.13 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 238 aa  67.4  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  36.91 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4149  phosphoribosyltransferase  42.28 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5977  hitchhiker  0.00513265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1824  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170025  normal  0.362057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1955  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.100641  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6279  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1800  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5101  phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>