220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1245 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
170 aa  176  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
170 aa  168  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  58.71 
 
 
171 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  54.43 
 
 
165 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  57.79 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
169 aa  158  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
170 aa  140  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
195 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  33.99 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
233 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
230 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.4 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  30.4 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  30.65 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 
181 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
186 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
188 aa  61.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
220 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  24.49 
 
 
236 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 
253 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  24.7 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
206 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  26 
 
 
218 aa  58.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
232 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
187 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  32.19 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
206 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 
224 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4149  phosphoribosyltransferase  40 
 
 
251 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5977  hitchhiker  0.00513265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  39.19 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
231 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.14 
 
 
188 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.49 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
256 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
220 aa  55.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
183 aa  54.3  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 
154 aa  54.3  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 
132 aa  53.9  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
154 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>