More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0637 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  58.99 
 
 
179 aa  218  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
191 aa  104  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
186 aa  103  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
180 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
205 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
218 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
206 aa  94.4  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
181 aa  94  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  30.99 
 
 
206 aa  88.6  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
170 aa  88.6  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
220 aa  88.2  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
230 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
224 aa  85.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
256 aa  82  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
232 aa  80.9  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
238 aa  80.9  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
238 aa  77.4  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  29.37 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2918  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
184 aa  61.6  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  31.06 
 
 
146 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  28.48 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
161 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
132 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0420  phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
253 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3617  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.11 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  30.6 
 
 
146 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0448  phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
172 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
152 aa  57.8  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
162 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
147 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  26.16 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.87 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf377  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
152 aa  54.7  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
179 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0449  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
181 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  25.87 
 
 
146 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1955  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.100641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>