97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1728 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1728  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  78.92 
 
 		 185 aa  321  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  73.91 
 
 		 186 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0833  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  73.66 
 
 		 188 aa  300  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0911  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.83 
 
 		 186 aa  297  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2923  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.58 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.263911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.04 
 
 		 188 aa  294  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  72.04 
 
 		 188 aa  294  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3539  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  72.53 
 
 		 187 aa  292  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0699859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0642  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.89 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3311  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.89 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3481  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.89 
 
 		 188 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.89 
 
 		 188 aa  289  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3183  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  288  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 188 aa  287  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.51 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02434  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  79.75 
 
 		 166 aa  277  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 188 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0786  phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 		 192 aa  215  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326785  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2008  phosphoribosyltransferase  54.8 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155102  hitchhiker  0.00381073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1159  phosphoribosyltransferase  48.42 
 
 		 207 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0103  phosphoribosyl transferase domain protein  32.02 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1545  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.47 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 147 aa  51.2  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1373  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  23.75 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  26.76 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  27.22 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0280  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  22.5 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1928  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2216  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0447  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0157865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0436  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  26.21 
 
 		 374 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  25 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0582  phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 171 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  22.88 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  24.34 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf377  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103753  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0329  phosphoribosyltransferase-like protein  27.46 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2918  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  23.12 
 
 		 256 aa  42.4  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 179 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0655  phosphoribosyltransferase family protein  30.69 
 
 		 136 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 		 206 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 170 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 180 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  22.35 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0718  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>