150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01159 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  93.51 
 
 
154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  82.47 
 
 
154 aa  276  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  75.66 
 
 
152 aa  253  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.52 
 
 
151 aa  237  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.79 
 
 
152 aa  228  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.79 
 
 
152 aa  227  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  227  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  225  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  225  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  224  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  65.13 
 
 
152 aa  224  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.47 
 
 
152 aa  224  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  66.44 
 
 
152 aa  221  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.74 
 
 
154 aa  213  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
162 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
165 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.94 
 
 
162 aa  153  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 
161 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
160 aa  150  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  47.3 
 
 
163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
167 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
167 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
173 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 
168 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.1 
 
 
167 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
154 aa  140  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.76 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
167 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
165 aa  136  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
168 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
165 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
165 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
164 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
159 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
165 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
174 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
176 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.95 
 
 
164 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
165 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 
165 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
173 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
186 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
188 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
188 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
192 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  35.51 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
205 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
170 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0222  hypothetical protein  32.77 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0429  nucleotide phosphoribosyltransferase, putative  29.17 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
220 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  31.93 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
176 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
238 aa  47.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
176 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
176 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
176 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.56 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  32.17 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>