193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2116 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2116  Xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.38 
 
 
165 aa  222  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.52 
 
 
168 aa  221  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3213  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.91 
 
 
172 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1131  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  67.31 
 
 
159 aa  220  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.89 
 
 
164 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  66.03 
 
 
168 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.01 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.26 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
168 aa  210  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.58 
 
 
164 aa  210  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2243  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
172 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.01 
 
 
165 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.01 
 
 
165 aa  208  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3155  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 
174 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 
173 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.64 
 
 
161 aa  202  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2473  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
173 aa  200  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3674  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.01 
 
 
165 aa  198  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2590  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.66 
 
 
168 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1506  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3025  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.23 
 
 
163 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.62 
 
 
165 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 
167 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 
167 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2747  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.74 
 
 
162 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
167 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2477  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.28 
 
 
172 aa  185  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00627128  normal  0.0241876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  56.77 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.28 
 
 
176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
167 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2097  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
162 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
188 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3172  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
186 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3143  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.167132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1064  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
192 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0457  Xanthine phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
154 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3319  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
185 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0964  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  151  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0764  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
152 aa  150  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3289  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0930  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
152 aa  148  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0235  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00233  xanthine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3369  Xanthine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0283  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.382963  normal  0.332523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2433  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
151 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0292  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133034 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00236  hypothetical protein  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3436  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3343  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0265  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
152 aa  148  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3304  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000126609  hitchhiker  0.000156844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0356  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3291  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0366  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0351  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0347  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3153  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0358  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000166936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0897  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0003  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
154 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1867  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.67 
 
 
154 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0975  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.935967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004271  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01159  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  28.76 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
174 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2529  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00263166  hitchhiker  0.000000130558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  34 
 
 
186 aa  54.3  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
195 aa  54.3  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
206 aa  54.3  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.98 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1607  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0880276  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1408  phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000053436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1738  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1711  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265584  normal  0.572209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>