More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0566 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0566  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
189 aa  383  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0161542  hitchhiker  0.00589759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
179 aa  186  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0017  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.54 
 
 
183 aa  177  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0532  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
179 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.187289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0545  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
179 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
180 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
179 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
174 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.86 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0187  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
186 aa  171  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
176 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1925  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 
178 aa  170  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
180 aa  169  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
181 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  168  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  168  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
180 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
179 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0149  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
179 aa  167  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
184 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
180 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.15 
 
 
199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1323  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
183 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
183 aa  161  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0061  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
181 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
182 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
169 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1847  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
187 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
182 aa  158  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0472  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
188 aa  157  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0108255  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
186 aa  157  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
176 aa  157  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0623  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
189 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
180 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
190 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
180 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  46.15 
 
 
176 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1785  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
189 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
181 aa  154  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
183 aa  154  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
186 aa  154  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
184 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
187 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
190 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
183 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
178 aa  151  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
176 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
176 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2106  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0971806  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3192  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
184 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
179 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
682 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
181 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
181 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
176 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
181 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
177 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
176 aa  148  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
176 aa  148  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2254  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
184 aa  148  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000437646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
183 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
176 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
175 aa  147  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
181 aa  147  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
174 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
473 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00597549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
178 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
177 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
195 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>