129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6349 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  97.1 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  59.18 
 
 		 225 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  58.16 
 
 		 248 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  58.29 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  58.97 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.65 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  35.52 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  30.98 
 
 		 192 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  35.52 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  35.52 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  35.52 
 
 		 357 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  36.18 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  35.9 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  34.97 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  35.82 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.57 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  30.57 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  31.18 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.26 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  32.64 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  28.88 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  27.32 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  28 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  25.37 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.2 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  23.32 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  33.73 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.11 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  32.82 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  35.54 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  31 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2913  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  37.21 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.29 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  29.69 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  31.76 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  27.33 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  37.78 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  36.26 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.33 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.33 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.57 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  22.98 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.03 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  31.16 
 
 		 409 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  36.56 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  28.49 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  37.63 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.6 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3181  HAD family hydrolase  28.4 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  29.69 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  27.06 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.65 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  28.49 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  38.16 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  27.55 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21900  HAD-superfamily hydrolase  36 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.61 
 
 		 488 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  37.5 
 
 		 278 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 289 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2626  putative hydrolase protein  28.72 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0368297  normal  0.12762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>