50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3700 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  100 
 
 		 227 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  68.81 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  60.73 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  61.79 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  58.29 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  58.08 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.1 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  29.26 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.94 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  31.66 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 357 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  26.67 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  33.17 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  29.65 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  28.27 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.78 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  29.76 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.95 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  26.26 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  24.49 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  23.5 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  26.34 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0125  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  26.9 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.75 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  27.13 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  22.02 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  37.36 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  24.48 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  23.89 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.06 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.19 
 
 		 488 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>