193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4049 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  38.04 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  35.08 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  35.08 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.32 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.57 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  31.28 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  32.66 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  35.15 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  32.81 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 227 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 248 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  31.77 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  31.52 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  28.65 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  34.9 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  31.77 
 
 		 268 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 357 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  29.47 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  30.1 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  31.68 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.45 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  25.64 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.8 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0515  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.26 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.589704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.72 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.8 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.54 
 
 		 258 aa  61.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  28 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  25.39 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.64 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8329  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.56 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  28 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.42 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  30 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.9 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  28.91 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.84 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.17 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5696  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0878159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.64 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0054  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.54 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  25 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  26.37 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  24.12 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3299  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 313 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.43 
 
 		 306 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  30.83 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.77 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  23.56 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  30.25 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.72 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  30.77 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1010  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.78 
 
 		 352 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  26.84 
 
 		 287 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.29 
 
 		 295 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0490  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 297 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  27.12 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.06 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.08 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.06 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.49 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.06 
 
 		 493 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  29.6 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>