54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3228 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  49.74 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  49.23 
 
 		 198 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  48.42 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  48.19 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  36.27 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  36.41 
 
 		 202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  35.38 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  31.22 
 
 		 192 aa  118  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.53 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.31 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  31.22 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 237 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 268 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  25.4 
 
 		 357 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  22.75 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  30 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  26.42 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  24.62 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  25 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.08 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  25.25 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  27.18 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  23.81 
 
 		 750 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.87 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.74 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6363  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  31.4 
 
 		 272 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.499829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  23.38 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.64 
 
 		 768 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 217 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  23.15 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  25.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  23.66 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.36 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.61 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  23.12 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2746  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.56 
 
 		 488 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>