183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2185 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  98.04 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  95.59 
 
 		 268 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  90.2 
 
 		 206 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  88.24 
 
 		 237 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  89.22 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  39.7 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  38.73 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.82 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  37.95 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  34.2 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.29 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  34.2 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  36.96 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  31.91 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  36.5 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  35.52 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  35.52 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  33.18 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  35.9 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  28.27 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  28.8 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  30.11 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  31.79 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  25.5 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.79 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  28.88 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  39.66 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.45 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.88 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 750 aa  61.6  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  34.33 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0125  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  32.98 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2236  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.43 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  28.26 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.27 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2080  phosphoserine phosphatase-like protein  30.25 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.642708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  26 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  25 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.84 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2564  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341145  normal  0.242767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1167  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.14 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.15 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  25.52 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  24.14 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4075  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 525 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.49 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.66 
 
 		 493 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.49 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  28.03 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  28.71 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  25 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1010  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.57 
 
 		 352 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6034  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.66 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  21.08 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2746  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484566 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  21.57 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2716  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.469859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.14 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2760  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.7 
 
 		 768 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  26.98 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.27 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.57 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  33.04 
 
 		 284 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.59 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.34 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  27.93 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 799 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.68 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  25.95 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  25.69 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>