73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0066 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  43.81 
 
 
198 aa  174  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  40.62 
 
 
196 aa  157  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  41.33 
 
 
198 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  41.24 
 
 
206 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  41.33 
 
 
198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  39.9 
 
 
204 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  32.98 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.08 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
357 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  34.2 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
268 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
206 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  40.2 
 
 
209 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
237 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  33.82 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  32.49 
 
 
196 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.93 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  30.57 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  30.57 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  30.53 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  30 
 
 
248 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  28.27 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  33.63 
 
 
750 aa  61.6  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.14 
 
 
768 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.28 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2080  phosphoserine phosphatase-like protein  30.41 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.642708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  25.67 
 
 
518 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  35.76 
 
 
297 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.84 
 
 
239 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  21.83 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.49 
 
 
488 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1432  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.57 
 
 
770 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.438652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  32.93 
 
 
297 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.92 
 
 
236 aa  52  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19450  phosphoserine phosphatase  28.43 
 
 
778 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
819 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  22.05 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.37 
 
 
233 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11300  phosphoserine phosphatase  22.33 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000517664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  34.03 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.37 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  32.03 
 
 
421 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.62 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  27.57 
 
 
369 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  25.59 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.09 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  24.34 
 
 
231 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2730  phosphoserine phosphatase SerB  27.92 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  20 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  28.05 
 
 
409 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  35.71 
 
 
316 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  35.71 
 
 
281 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  24.26 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  30.66 
 
 
417 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  30.66 
 
 
417 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  30.66 
 
 
417 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  25.93 
 
 
280 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  30.16 
 
 
404 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.26 
 
 
237 aa  42  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  29.84 
 
 
405 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
218 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1170  SerB family protein  33.33 
 
 
290 aa  41.6  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  26.6 
 
 
411 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  34.69 
 
 
279 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11600  phosphoserine phosphatase SerB  30.71 
 
 
278 aa  41.6  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>