79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0939 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  96.89 
 
 		 248 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  61.24 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  61.79 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  59.18 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  58.16 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  37.95 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.77 
 
 		 196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 357 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  34.12 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.57 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  32.99 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  27.13 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  30.53 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  29.74 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  28.14 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.5 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  26.84 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  24.63 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  25.65 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.81 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  28.12 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  29.34 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  25 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  24.39 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  28.92 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.31 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  23.65 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.56 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  29.34 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  25.13 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.8 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 518 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  25 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.32 
 
 		 265 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  25 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  25 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  27.16 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.35 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  26.95 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2447  HAD family hydrolase  23.28 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  26.63 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  23.62 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3846  HAD family hydrolase  25.15 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  25.15 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.69 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  25.15 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  25 
 
 		 218 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.64 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>