173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0237 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  100 
 
 		 211 aa  423  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  43.4 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.18 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  30.61 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.27 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  32.99 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.44 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.75 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.07 
 
 		 297 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2236  HAD family hydrolase  21.66 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  21.62 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  23.87 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  28.12 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  23.3 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8329  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  21.62 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2447  HAD family hydrolase  23.85 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.64 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  24.56 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  24.44 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  24.63 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6738  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.12 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  23.64 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  24.11 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.57 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  24.11 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6219  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  23.74 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  23.5 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0069  HAD family hydrolase  23.92 
 
 		 295 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0248353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.5 
 
 		 311 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  22.22 
 
 		 290 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.62 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  22.9 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3259  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  20.2 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  20.36 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.42 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.18 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  24.06 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  21.78 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0674  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4355  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  19.44 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0687  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  21.23 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0667  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1313  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2080  phosphoserine phosphatase-like protein  25.34 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.642708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3098  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.15 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11300  phosphoserine phosphatase  29.06 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000517664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.93 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0843  HAD family hydrolase  24 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163877  normal  0.772835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  23.29 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02790  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  21.9 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2011  phosphoserine phosphatase  25.51 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.291449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6135  HAD family hydrolase  21.57 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.23 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.22 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  24.24 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  21.53 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10516  phosphoserine phosphatase serB1  24.88 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1010  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.64 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.02 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4446  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  20.28 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.33 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2740  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.79 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1316  HAD family hydrolase  19.73 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  22.77 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0490  HAD family hydrolase  22.12 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  24.07 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1214  HAD family hydrolase  20.72 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0418  HAD family hydrolase  21.29 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1681  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.786603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>