119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2236 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2236  HAD family hydrolase  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  43.18 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  38.18 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  23.53 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  21.66 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.59 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.08 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  25.78 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3749  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.045267 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.67 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  19.9 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  24.22 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.09 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  32.06 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.15 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2929  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.57 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2992  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0456424  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2419  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.71 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.96 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.51 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.95 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1925  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.8 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1167  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  29 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  25.36 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.43 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.6 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 233 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  29.93 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.2 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2578  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  27.37 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  29.17 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  25.88 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  28.23 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2510  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.261496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1214  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  28.33 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0515  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.4 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.589704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  27.56 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  30.33 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  25.36 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  30.71 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  31.2 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0902  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.9 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1032  hypothetical protein  19.05 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0756  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.9 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.31 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8329  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.5 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  28 
 
 		 750 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48250  HAD-superfamily hydrolase subfamily IB, PSPase-like protein  28.81 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.92 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4585  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.6 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1270  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0449796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  23.74 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0418  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 312 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  25.95 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  25.57 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  26.72 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4703  HAD family hydrolase  26.43 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.95 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  25.34 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  26.72 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  23.85 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.35 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  33.65 
 
 		 477 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  23.85 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.8 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1870  hypothetical protein  22.58 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.07 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3743  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.46 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10516  phosphoserine phosphatase serB1  28.95 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  21.82 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3131  HAD family hydrolase  25.43 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.61 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>