193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2224 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  100 
 
 		 227 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  99.03 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  87.84 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  87.33 
 
 		 268 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  89.22 
 
 		 206 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  89.22 
 
 		 206 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  80.7 
 
 		 237 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  39.2 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  38.02 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  38.73 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  33.87 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  36.08 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.29 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  36.96 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  32.98 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  36.07 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  36.07 
 
 		 207 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  29.95 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  31.38 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  34 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  27.75 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  23.5 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  35.11 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  31.66 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.41 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  24.5 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  29.63 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  28.71 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.37 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2087  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00266008  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.05 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2746  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2716  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.469859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2760  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  37.76 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.99 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4075  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2564  HAD family hydrolase  32.1 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341145  normal  0.242767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.69 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  26.84 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0125  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  31.41 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.08 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1167  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  25.25 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.32 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.11 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.11 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.53 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2615  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  27 
 
 		 750 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.34 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3883  HAD-superfamily hydrolase  28.03 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1214  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3285  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.27 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3624  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.5 
 
 		 561 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.18 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1584  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.77 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0112801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.05 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2236  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3619  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.5 
 
 		 561 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00474083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0426  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3692  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.5 
 
 		 561 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.000184882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1010  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.32 
 
 		 352 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1601  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  21.57 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.67 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0813  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00498763  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  22.5 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7528  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2080  phosphoserine phosphatase-like protein  29.45 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.642708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>