164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1009 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  100 
 
 		 217 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  41.62 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  41.62 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 268 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  38.73 
 
 		 357 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  35.57 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  39.39 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  33.33 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  35.03 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  36.65 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  31.7 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  32.99 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  33.67 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  32.57 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 220 aa  94.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.33 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  31.94 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  34.57 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  30.93 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  34.95 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  31.98 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  31.47 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  24.27 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2741  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0707173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  24.75 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.37 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.38 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.63 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27140  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.92 
 
 		 768 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  20.3 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3562  HAD family hydrolase  26.76 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.271633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 799 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0482  HAD family hydrolase  30 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 750 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4219  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1214  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0597827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  24.4 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3285  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3628  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.46 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.856585  hitchhiker  0.00143877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1328  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.13 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1226  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.13 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3061  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.29 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.4 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1167  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2094  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.07906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 819 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.32 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1770  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2746  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3369  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.16 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35940  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.23 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  26.53 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0837  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2716  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.469859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  26.02 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2760  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2629  putative hydrolase protein  26.96 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.283045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.49 
 
 		 275 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2765  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  24.17 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4041  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  25 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  27.23 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0991  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.5 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07130  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.02 
 
 		 311 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0395  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  26.54 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2236  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  23.92 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.3 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1327  HAD family hydrolase  25 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00757114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.57 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  31.05 
 
 		 270 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4170  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 787 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243579  normal  0.356217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1432  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.19 
 
 		 770 aa  48.5  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.438652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>