50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1271 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  26.4 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0237  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2313  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  23.9 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.17 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  23.9 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  22.28 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0644  Phosphoserine phosphatase-like protein  24.75 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4234  hypothetical protein  25.37 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  23.4 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  24.1 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2094  HAD family hydrolase  24.75 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.07906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0674  HAD family hydrolase  23.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0667  HAD family hydrolase  23.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0687  HAD family hydrolase  23.12 
 
 		 300 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02790  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.12 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0590  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.3 
 
 		 280 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.841556  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  22.89 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  22.45 
 
 		 287 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.12 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1529  hypothetical protein  22.73 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1443  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase- like)  21.54 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0665  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  23.36 
 
 		 295 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.406953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.57 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.11 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  23.62 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  23.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  25.59 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  24.26 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3259  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  22.56 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  24.75 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1886  phosphoserine phosphatase SerB  25.13 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2649  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.34 
 
 		 238 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  26.02 
 
 		 207 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.72 
 
 		 270 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  26.36 
 
 		 284 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10516  phosphoserine phosphatase serB1  23.38 
 
 		 373 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6738  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  25.12 
 
 		 294 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  21.88 
 
 		 313 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  23.53 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>