138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000906 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000906  phosphoserine phosphatase  100 
 
 		 206 aa  430  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06910  hypothetical protein  68.97 
 
 		 204 aa  304  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1573  HAD family hydrolase  47.94 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  48.19 
 
 		 196 aa  197  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2775  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  46.91 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879382 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0066  HAD-superfamily, subfamily IB hydrolase  41.24 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.532274 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0134  HAD family hydrolase  41.24 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  41.3 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01789  phosphotransferase  37.63 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0123096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1221  phosphoserine phosphatase  35.68 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4049  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.47 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17656  normal  0.0174812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1009  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.67 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1089  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 237 aa  94.7  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1949  HAD family hydrolase  36.22 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4027  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.475735  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5502  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.806143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0508  HAD family hydrolase  31.12 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5892  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2185  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2202  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 357 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0939  HAD-superfamily hydrolase  32.99 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03340  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.212036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0807  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6349  hypothetical protein  28.88 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2847  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73150  hypothetical protein  28.42 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3903  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  29.76 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1268  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00200107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2187  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0674  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0606  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.7 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000630267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33380  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.53 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0436  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.5 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000408173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3117  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.22 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1382  HAD family hydrolase  27.04 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0503045  normal  0.084913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1315  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12860  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.27 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0281228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.79 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0745  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.17 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00362986  normal  0.517571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3954  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2319  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3313  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0520  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5423  HAD family hydrolase  31.45 
 
 		 313 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988036 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0508  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1091  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.494878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3270  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.487374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3303  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2198  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.409073  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08610  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.87 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.294075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1624  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2626  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2490  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4807  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 285 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4893  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 285 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5194  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 285 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421915  hitchhiker  0.000238579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2799  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3285  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13691  hypothetical protein  30.53 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.148419  normal  0.360878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4206  HAD family hydrolase  27.55 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.75 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0678  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0275  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0653  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0759  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1271  HAD family hydrolase  22.28 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0728  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3021  hypothetical protein  24.64 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6363  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase TIGR01490  27.64 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.499829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0818  hypothetical protein  26.73 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2776  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0302867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1972  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0999  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0230421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3004  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 254 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886129  normal  0.404374 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0119  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.14 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000400181  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  26.53 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3910  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase  32.26 
 
 		 284 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0320  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.6 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2455  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.5 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2017  HAD family hydrolase  25.6 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  24.24 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2992  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1764  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5002  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.96 
 
 		 488 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1721  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566146  normal  0.0514647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0054  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.7 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3998  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2861  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  27.5 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>